Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmd4O35226 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms