Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pitx3O35160 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms