Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sypl1O09117 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms