Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EllO08856 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EllO08856 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EllO08856 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EllO08856 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EllO08856 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EllO08856 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EllO08856 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EllO08856 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EllO08856 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EllO08856 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms