Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eftud2O08810 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eftud2O08810 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms