Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfil3O08750 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms