Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms