Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20939L7N243 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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