Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
IfnabL7MTU6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IfnabL7MTU6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms