Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm8888J3QPX5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8888J3QPX5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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