Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms