Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5849J3QPE5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5849J3QPE5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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