Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BC024978J3QPC3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC024978J3QPC3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms