Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm933J3QPC1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms