Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smim18J3QNP2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms