Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccdc180J3QNE4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc180J3QNE4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms