Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm11236J3QMS7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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