Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms