Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bbip1J3QMK2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bbip1J3QMK2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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