Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20825J3QM67 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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