Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930544D05RikJ3QK56 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930544D05RikJ3QK56 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms