Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms