Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm21818J3KMS6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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