Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pot1bH7BX60 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms