Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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