Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubgcp6G5E8P0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms