Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H5

Tpte, MCG118205, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpteG5E8H5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TpteG5E8H5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms