Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ScaperF8VQ70 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ScaperF8VQ70 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms