Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms