Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc37F8VPK0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc37F8VPK0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms