Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms