Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Crocc2F6XLV1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms