Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm17555F6U8B9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms