Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syngap1F6SEU4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngap1F6SEU4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms