Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TrdnE9Q9K5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms