Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Arhgef5E9Q7D5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef5E9Q7D5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arhgef5E9Q7D5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Arhgef5E9Q7D5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Arhgef5E9Q7D5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arhgef5E9Q7D5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arhgef5E9Q7D5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef5E9Q7D5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms