Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms