Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D8

C6, Complement component 6, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6E9Q6D8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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C6E9Q6D8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6E9Q6D8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms