Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700024B05RikE9Q6D7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms