Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms