Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2237E9Q501 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2237E9Q501 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms