Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r238E9Q373 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms