Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ccdc171E9Q1U1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Ccdc171E9Q1U1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Ccdc171E9Q1U1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Ccdc171E9Q1U1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc171E9Q1U1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Ccdc171E9Q1U1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Ccdc171E9Q1U1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Ccdc171E9Q1U1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc171E9Q1U1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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