Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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