Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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