Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms