Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20425E9Q035 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms