Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gcom1E9PZ54 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms