Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp54bE9PXC0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms