Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a3E9PWQ3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms